Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hsf4Q9R0L1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hsf4Q9R0L1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hsf4Q9R0L1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hsf4Q9R0L1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsf4Q9R0L1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsf4Q9R0L1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsf4Q9R0L1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hsf4Q9R0L1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hsf4Q9R0L1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hsf4Q9R0L1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hsf4Q9R0L1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hsf4Q9R0L1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hsf4Q9R0L1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hsf4Q9R0L1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hsf4Q9R0L1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hsf4Q9R0L1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hsf4Q9R0L1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hsf4Q9R0L1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hsf4Q9R0L1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hsf4Q9R0L1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hsf4Q9R0L1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hsf4Q9R0L1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hsf4Q9R0L1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hsf4Q9R0L1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hsf4Q9R0L1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hsf4Q9R0L1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms