Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Lamc3Q9R0B6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Lamc3Q9R0B6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC45.75■■■■■ 4.92
Lamc3Q9R0B6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
Lamc3Q9R0B6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Lamc3Q9R0B6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Lamc3Q9R0B6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
Lamc3Q9R0B6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Lamc3Q9R0B6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
Lamc3Q9R0B6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Lamc3Q9R0B6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Lamc3Q9R0B6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC45.44■■■■■ 4.86
Lamc3Q9R0B6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Lamc3Q9R0B6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC45.41■■■■■ 4.86
Lamc3Q9R0B6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Lamc3Q9R0B6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Lamc3Q9R0B6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Lamc3Q9R0B6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
Lamc3Q9R0B6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.34■■■■■ 4.85
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Lamc3Q9R0B6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
Lamc3Q9R0B6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
Lamc3Q9R0B6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
Lamc3Q9R0B6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
Lamc3Q9R0B6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Lamc3Q9R0B6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Lamc3Q9R0B6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Lamc3Q9R0B6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
Lamc3Q9R0B6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Lamc3Q9R0B6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Lamc3Q9R0B6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Lamc3Q9R0B6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Lamc3Q9R0B6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Lamc3Q9R0B6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
Lamc3Q9R0B6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
Lamc3Q9R0B6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Lamc3Q9R0B6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Lamc3Q9R0B6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
Lamc3Q9R0B6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Lamc3Q9R0B6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Lamc3Q9R0B6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
Lamc3Q9R0B6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.8
Lamc3Q9R0B6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.8
Lamc3Q9R0B6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Lamc3Q9R0B6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Lamc3Q9R0B6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Lamc3Q9R0B6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Lamc3Q9R0B6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC45■■■■■ 4.79
Lamc3Q9R0B6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Lamc3Q9R0B6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Lamc3Q9R0B6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Lamc3Q9R0B6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Lamc3Q9R0B6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Lamc3Q9R0B6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Lamc3Q9R0B6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Lamc3Q9R0B6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
Lamc3Q9R0B6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
Lamc3Q9R0B6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC44.78■■■■■ 4.76
Lamc3Q9R0B6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
Lamc3Q9R0B6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC44.76■■■■■ 4.76
Lamc3Q9R0B6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.75
Lamc3Q9R0B6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Lamc3Q9R0B6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
Lamc3Q9R0B6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
Lamc3Q9R0B6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
Lamc3Q9R0B6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
Lamc3Q9R0B6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
Lamc3Q9R0B6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Lamc3Q9R0B6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
Lamc3Q9R0B6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
Lamc3Q9R0B6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
Lamc3Q9R0B6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
Lamc3Q9R0B6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
Lamc3Q9R0B6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Lamc3Q9R0B6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Lamc3Q9R0B6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
Lamc3Q9R0B6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Lamc3Q9R0B6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Lamc3Q9R0B6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Lamc3Q9R0B6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Lamc3Q9R0B6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
Lamc3Q9R0B6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Lamc3Q9R0B6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Lamc3Q9R0B6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC44.27■■■■■ 4.68
Lamc3Q9R0B6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
Lamc3Q9R0B6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Lamc3Q9R0B6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Lamc3Q9R0B6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Lamc3Q9R0B6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Lamc3Q9R0B6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Lamc3Q9R0B6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Lamc3Q9R0B6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Lamc3Q9R0B6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Lamc3Q9R0B6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Lamc3Q9R0B6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
Lamc3Q9R0B6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
Lamc3Q9R0B6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
Lamc3Q9R0B6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Lamc3Q9R0B6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Lamc3Q9R0B6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms