Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp11cQ9QZW0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp11cQ9QZW0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp11cQ9QZW0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp11cQ9QZW0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp11cQ9QZW0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp11cQ9QZW0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp11cQ9QZW0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp11cQ9QZW0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp11cQ9QZW0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp11cQ9QZW0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp11cQ9QZW0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp11cQ9QZW0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp11cQ9QZW0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp11cQ9QZW0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp11cQ9QZW0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp11cQ9QZW0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp11cQ9QZW0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp11cQ9QZW0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp11cQ9QZW0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp11cQ9QZW0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp11cQ9QZW0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp11cQ9QZW0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp11cQ9QZW0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp11cQ9QZW0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp11cQ9QZW0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp11cQ9QZW0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp11cQ9QZW0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp11cQ9QZW0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp11cQ9QZW0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp11cQ9QZW0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp11cQ9QZW0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp11cQ9QZW0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp11cQ9QZW0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp11cQ9QZW0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp11cQ9QZW0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp11cQ9QZW0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp11cQ9QZW0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp11cQ9QZW0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp11cQ9QZW0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp11cQ9QZW0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp11cQ9QZW0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp11cQ9QZW0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp11cQ9QZW0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp11cQ9QZW0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp11cQ9QZW0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp11cQ9QZW0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp11cQ9QZW0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp11cQ9QZW0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp11cQ9QZW0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp11cQ9QZW0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp11cQ9QZW0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp11cQ9QZW0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp11cQ9QZW0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp11cQ9QZW0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp11cQ9QZW0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp11cQ9QZW0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp11cQ9QZW0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp11cQ9QZW0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp11cQ9QZW0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp11cQ9QZW0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp11cQ9QZW0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp11cQ9QZW0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp11cQ9QZW0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp11cQ9QZW0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp11cQ9QZW0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp11cQ9QZW0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp11cQ9QZW0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp11cQ9QZW0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp11cQ9QZW0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp11cQ9QZW0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp11cQ9QZW0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp11cQ9QZW0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp11cQ9QZW0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp11cQ9QZW0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp11cQ9QZW0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp11cQ9QZW0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp11cQ9QZW0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp11cQ9QZW0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp11cQ9QZW0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp11cQ9QZW0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp11cQ9QZW0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp11cQ9QZW0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp11cQ9QZW0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp11cQ9QZW0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp11cQ9QZW0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp11cQ9QZW0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp11cQ9QZW0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp11cQ9QZW0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp11cQ9QZW0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp11cQ9QZW0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms