Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS3

Numb, Protein numb homolog, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumbQ9QZS3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NumbQ9QZS3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NumbQ9QZS3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NumbQ9QZS3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NumbQ9QZS3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NumbQ9QZS3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NumbQ9QZS3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NumbQ9QZS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NumbQ9QZS3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NumbQ9QZS3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NumbQ9QZS3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NumbQ9QZS3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NumbQ9QZS3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NumbQ9QZS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NumbQ9QZS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NumbQ9QZS3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NumbQ9QZS3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NumbQ9QZS3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NumbQ9QZS3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NumbQ9QZS3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NumbQ9QZS3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NumbQ9QZS3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NumbQ9QZS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NumbQ9QZS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NumbQ9QZS3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NumbQ9QZS3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NumbQ9QZS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NumbQ9QZS3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NumbQ9QZS3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NumbQ9QZS3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NumbQ9QZS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NumbQ9QZS3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NumbQ9QZS3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NumbQ9QZS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NumbQ9QZS3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NumbQ9QZS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NumbQ9QZS3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NumbQ9QZS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NumbQ9QZS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NumbQ9QZS3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NumbQ9QZS3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NumbQ9QZS3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NumbQ9QZS3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NumbQ9QZS3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NumbQ9QZS3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NumbQ9QZS3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NumbQ9QZS3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NumbQ9QZS3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NumbQ9QZS3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NumbQ9QZS3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NumbQ9QZS3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NumbQ9QZS3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NumbQ9QZS3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NumbQ9QZS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NumbQ9QZS3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NumbQ9QZS3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NumbQ9QZS3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NumbQ9QZS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NumbQ9QZS3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NumbQ9QZS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NumbQ9QZS3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NumbQ9QZS3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NumbQ9QZS3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NumbQ9QZS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NumbQ9QZS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NumbQ9QZS3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NumbQ9QZS3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NumbQ9QZS3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NumbQ9QZS3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NumbQ9QZS3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NumbQ9QZS3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NumbQ9QZS3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NumbQ9QZS3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NumbQ9QZS3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NumbQ9QZS3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NumbQ9QZS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NumbQ9QZS3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms