Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ehd3Q9QXY6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ehd3Q9QXY6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ehd3Q9QXY6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ehd3Q9QXY6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ehd3Q9QXY6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ehd3Q9QXY6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ehd3Q9QXY6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ehd3Q9QXY6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ehd3Q9QXY6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ehd3Q9QXY6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ehd3Q9QXY6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ehd3Q9QXY6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ehd3Q9QXY6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ehd3Q9QXY6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ehd3Q9QXY6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ehd3Q9QXY6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ehd3Q9QXY6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ehd3Q9QXY6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ehd3Q9QXY6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ehd3Q9QXY6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ehd3Q9QXY6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ehd3Q9QXY6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ehd3Q9QXY6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ehd3Q9QXY6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ehd3Q9QXY6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ehd3Q9QXY6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ehd3Q9QXY6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ehd3Q9QXY6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ehd3Q9QXY6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ehd3Q9QXY6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ehd3Q9QXY6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ehd3Q9QXY6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ehd3Q9QXY6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ehd3Q9QXY6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ehd3Q9QXY6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ehd3Q9QXY6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ehd3Q9QXY6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ehd3Q9QXY6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ehd3Q9QXY6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ehd3Q9QXY6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ehd3Q9QXY6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ehd3Q9QXY6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ehd3Q9QXY6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ehd3Q9QXY6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ehd3Q9QXY6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ehd3Q9QXY6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ehd3Q9QXY6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ehd3Q9QXY6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ehd3Q9QXY6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ehd3Q9QXY6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ehd3Q9QXY6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ehd3Q9QXY6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ehd3Q9QXY6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ehd3Q9QXY6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ehd3Q9QXY6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ehd3Q9QXY6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ehd3Q9QXY6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ehd3Q9QXY6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ehd3Q9QXY6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ehd3Q9QXY6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ehd3Q9QXY6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ehd3Q9QXY6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ehd3Q9QXY6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ehd3Q9QXY6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ehd3Q9QXY6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ehd3Q9QXY6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ehd3Q9QXY6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ehd3Q9QXY6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ehd3Q9QXY6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms