Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Chaf1aQ9QWF0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Chaf1aQ9QWF0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Chaf1aQ9QWF0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Chaf1aQ9QWF0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chaf1aQ9QWF0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Chaf1aQ9QWF0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Chaf1aQ9QWF0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Chaf1aQ9QWF0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chaf1aQ9QWF0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Chaf1aQ9QWF0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Chaf1aQ9QWF0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Chaf1aQ9QWF0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Chaf1aQ9QWF0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chaf1aQ9QWF0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Chaf1aQ9QWF0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Chaf1aQ9QWF0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Chaf1aQ9QWF0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Chaf1aQ9QWF0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Chaf1aQ9QWF0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Chaf1aQ9QWF0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chaf1aQ9QWF0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Chaf1aQ9QWF0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Chaf1aQ9QWF0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Chaf1aQ9QWF0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chaf1aQ9QWF0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chaf1aQ9QWF0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Chaf1aQ9QWF0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Chaf1aQ9QWF0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chaf1aQ9QWF0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chaf1aQ9QWF0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chaf1aQ9QWF0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Chaf1aQ9QWF0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Chaf1aQ9QWF0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Chaf1aQ9QWF0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chaf1aQ9QWF0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chaf1aQ9QWF0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chaf1aQ9QWF0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chaf1aQ9QWF0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chaf1aQ9QWF0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Chaf1aQ9QWF0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chaf1aQ9QWF0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Chaf1aQ9QWF0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chaf1aQ9QWF0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chaf1aQ9QWF0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chaf1aQ9QWF0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chaf1aQ9QWF0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chaf1aQ9QWF0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chaf1aQ9QWF0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chaf1aQ9QWF0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chaf1aQ9QWF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chaf1aQ9QWF0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chaf1aQ9QWF0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chaf1aQ9QWF0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chaf1aQ9QWF0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Chaf1aQ9QWF0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chaf1aQ9QWF0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chaf1aQ9QWF0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chaf1aQ9QWF0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Chaf1aQ9QWF0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chaf1aQ9QWF0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chaf1aQ9QWF0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chaf1aQ9QWF0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chaf1aQ9QWF0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Chaf1aQ9QWF0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chaf1aQ9QWF0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chaf1aQ9QWF0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chaf1aQ9QWF0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chaf1aQ9QWF0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chaf1aQ9QWF0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chaf1aQ9QWF0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Chaf1aQ9QWF0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chaf1aQ9QWF0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chaf1aQ9QWF0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Chaf1aQ9QWF0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chaf1aQ9QWF0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chaf1aQ9QWF0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chaf1aQ9QWF0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chaf1aQ9QWF0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Chaf1aQ9QWF0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chaf1aQ9QWF0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chaf1aQ9QWF0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chaf1aQ9QWF0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Chaf1aQ9QWF0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms