Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl3Q9JMG7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl3Q9JMG7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl3Q9JMG7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl3Q9JMG7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl3Q9JMG7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl3Q9JMG7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl3Q9JMG7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl3Q9JMG7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdgfl3Q9JMG7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Hdgfl3Q9JMG7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hdgfl3Q9JMG7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hdgfl3Q9JMG7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hdgfl3Q9JMG7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Hdgfl3Q9JMG7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hdgfl3Q9JMG7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hdgfl3Q9JMG7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hdgfl3Q9JMG7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hdgfl3Q9JMG7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hdgfl3Q9JMG7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hdgfl3Q9JMG7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hdgfl3Q9JMG7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hdgfl3Q9JMG7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl3Q9JMG7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hdgfl3Q9JMG7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hdgfl3Q9JMG7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hdgfl3Q9JMG7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hdgfl3Q9JMG7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hdgfl3Q9JMG7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hdgfl3Q9JMG7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hdgfl3Q9JMG7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hdgfl3Q9JMG7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hdgfl3Q9JMG7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hdgfl3Q9JMG7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hdgfl3Q9JMG7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hdgfl3Q9JMG7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hdgfl3Q9JMG7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hdgfl3Q9JMG7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl3Q9JMG7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl3Q9JMG7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl3Q9JMG7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl3Q9JMG7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl3Q9JMG7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl3Q9JMG7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl3Q9JMG7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl3Q9JMG7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl3Q9JMG7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms