Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Kcnq4Q9JK97 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnq4Q9JK97 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnq4Q9JK97 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kcnq4Q9JK97 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Kcnq4Q9JK97 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kcnq4Q9JK97 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Kcnq4Q9JK97 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kcnq4Q9JK97 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kcnq4Q9JK97 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kcnq4Q9JK97 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kcnq4Q9JK97 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Kcnq4Q9JK97 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnq4Q9JK97 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kcnq4Q9JK97 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnq4Q9JK97 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnq4Q9JK97 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kcnq4Q9JK97 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kcnq4Q9JK97 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kcnq4Q9JK97 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kcnq4Q9JK97 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kcnq4Q9JK97 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kcnq4Q9JK97 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kcnq4Q9JK97 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kcnq4Q9JK97 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kcnq4Q9JK97 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Kcnq4Q9JK97 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnq4Q9JK97 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnq4Q9JK97 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kcnq4Q9JK97 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kcnq4Q9JK97 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnq4Q9JK97 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kcnq4Q9JK97 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnq4Q9JK97 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnq4Q9JK97 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kcnq4Q9JK97 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kcnq4Q9JK97 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kcnq4Q9JK97 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Kcnq4Q9JK97 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Kcnq4Q9JK97 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcnq4Q9JK97 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kcnq4Q9JK97 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kcnq4Q9JK97 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kcnq4Q9JK97 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kcnq4Q9JK97 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kcnq4Q9JK97 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kcnq4Q9JK97 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kcnq4Q9JK97 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kcnq4Q9JK97 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Kcnq4Q9JK97 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Kcnq4Q9JK97 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Kcnq4Q9JK97 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnq4Q9JK97 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Kcnq4Q9JK97 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnq4Q9JK97 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Kcnq4Q9JK97 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Kcnq4Q9JK97 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnq4Q9JK97 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Kcnq4Q9JK97 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Kcnq4Q9JK97 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Kcnq4Q9JK97 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Kcnq4Q9JK97 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Kcnq4Q9JK97 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kcnq4Q9JK97 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kcnq4Q9JK97 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnq4Q9JK97 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnq4Q9JK97 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kcnq4Q9JK97 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kcnq4Q9JK97 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms