Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gfra4Q9JJT2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gfra4Q9JJT2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gfra4Q9JJT2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gfra4Q9JJT2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gfra4Q9JJT2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gfra4Q9JJT2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gfra4Q9JJT2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gfra4Q9JJT2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gfra4Q9JJT2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gfra4Q9JJT2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gfra4Q9JJT2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gfra4Q9JJT2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gfra4Q9JJT2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gfra4Q9JJT2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gfra4Q9JJT2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gfra4Q9JJT2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gfra4Q9JJT2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gfra4Q9JJT2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gfra4Q9JJT2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Gfra4Q9JJT2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gfra4Q9JJT2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gfra4Q9JJT2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gfra4Q9JJT2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gfra4Q9JJT2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gfra4Q9JJT2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gfra4Q9JJT2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gfra4Q9JJT2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gfra4Q9JJT2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gfra4Q9JJT2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gfra4Q9JJT2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gfra4Q9JJT2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gfra4Q9JJT2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gfra4Q9JJT2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gfra4Q9JJT2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gfra4Q9JJT2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gfra4Q9JJT2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gfra4Q9JJT2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gfra4Q9JJT2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gfra4Q9JJT2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gfra4Q9JJT2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gfra4Q9JJT2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gfra4Q9JJT2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gfra4Q9JJT2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Gfra4Q9JJT2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gfra4Q9JJT2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gfra4Q9JJT2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gfra4Q9JJT2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gfra4Q9JJT2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gfra4Q9JJT2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gfra4Q9JJT2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gfra4Q9JJT2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gfra4Q9JJT2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gfra4Q9JJT2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gfra4Q9JJT2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gfra4Q9JJT2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gfra4Q9JJT2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gfra4Q9JJT2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gfra4Q9JJT2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gfra4Q9JJT2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gfra4Q9JJT2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gfra4Q9JJT2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gfra4Q9JJT2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gfra4Q9JJT2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gfra4Q9JJT2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gfra4Q9JJT2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gfra4Q9JJT2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gfra4Q9JJT2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gfra4Q9JJT2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gfra4Q9JJT2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gfra4Q9JJT2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gfra4Q9JJT2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gfra4Q9JJT2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gfra4Q9JJT2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Gfra4Q9JJT2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gfra4Q9JJT2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gfra4Q9JJT2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gfra4Q9JJT2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gfra4Q9JJT2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gfra4Q9JJT2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gfra4Q9JJT2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gfra4Q9JJT2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gfra4Q9JJT2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gfra4Q9JJT2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gfra4Q9JJT2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gfra4Q9JJT2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gfra4Q9JJT2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms