Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lmbr1Q9JIT0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmbr1Q9JIT0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lmbr1Q9JIT0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lmbr1Q9JIT0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lmbr1Q9JIT0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmbr1Q9JIT0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Lmbr1Q9JIT0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmbr1Q9JIT0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lmbr1Q9JIT0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lmbr1Q9JIT0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lmbr1Q9JIT0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Lmbr1Q9JIT0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lmbr1Q9JIT0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lmbr1Q9JIT0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lmbr1Q9JIT0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lmbr1Q9JIT0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lmbr1Q9JIT0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmbr1Q9JIT0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmbr1Q9JIT0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lmbr1Q9JIT0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lmbr1Q9JIT0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lmbr1Q9JIT0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lmbr1Q9JIT0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lmbr1Q9JIT0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lmbr1Q9JIT0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lmbr1Q9JIT0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lmbr1Q9JIT0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Lmbr1Q9JIT0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lmbr1Q9JIT0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lmbr1Q9JIT0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lmbr1Q9JIT0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lmbr1Q9JIT0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Lmbr1Q9JIT0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lmbr1Q9JIT0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lmbr1Q9JIT0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Lmbr1Q9JIT0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Lmbr1Q9JIT0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lmbr1Q9JIT0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmbr1Q9JIT0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lmbr1Q9JIT0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Lmbr1Q9JIT0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmbr1Q9JIT0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lmbr1Q9JIT0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Lmbr1Q9JIT0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmbr1Q9JIT0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lmbr1Q9JIT0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmbr1Q9JIT0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Lmbr1Q9JIT0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmbr1Q9JIT0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lmbr1Q9JIT0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmbr1Q9JIT0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lmbr1Q9JIT0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lmbr1Q9JIT0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lmbr1Q9JIT0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmbr1Q9JIT0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmbr1Q9JIT0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lmbr1Q9JIT0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lmbr1Q9JIT0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmbr1Q9JIT0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lmbr1Q9JIT0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lmbr1Q9JIT0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lmbr1Q9JIT0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmbr1Q9JIT0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lmbr1Q9JIT0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmbr1Q9JIT0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmbr1Q9JIT0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmbr1Q9JIT0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lmbr1Q9JIT0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lmbr1Q9JIT0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmbr1Q9JIT0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmbr1Q9JIT0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmbr1Q9JIT0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmbr1Q9JIT0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lmbr1Q9JIT0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lmbr1Q9JIT0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmbr1Q9JIT0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmbr1Q9JIT0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmbr1Q9JIT0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lmbr1Q9JIT0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lmbr1Q9JIT0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Lmbr1Q9JIT0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms