Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Tulp4Q9JIL5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Tulp4Q9JIL5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Tulp4Q9JIL5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Tulp4Q9JIL5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Tulp4Q9JIL5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Tulp4Q9JIL5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Tulp4Q9JIL5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Tulp4Q9JIL5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Tulp4Q9JIL5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Tulp4Q9JIL5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Tulp4Q9JIL5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Tulp4Q9JIL5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Tulp4Q9JIL5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Tulp4Q9JIL5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Tulp4Q9JIL5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Tulp4Q9JIL5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Tulp4Q9JIL5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Tulp4Q9JIL5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Tulp4Q9JIL5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Tulp4Q9JIL5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Tulp4Q9JIL5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Tulp4Q9JIL5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Tulp4Q9JIL5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Tulp4Q9JIL5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Tulp4Q9JIL5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Tulp4Q9JIL5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Tulp4Q9JIL5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Tulp4Q9JIL5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Tulp4Q9JIL5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Tulp4Q9JIL5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Tulp4Q9JIL5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Tulp4Q9JIL5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Tulp4Q9JIL5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Tulp4Q9JIL5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Tulp4Q9JIL5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Tulp4Q9JIL5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Tulp4Q9JIL5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Tulp4Q9JIL5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Tulp4Q9JIL5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Tulp4Q9JIL5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Tulp4Q9JIL5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Tulp4Q9JIL5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Tulp4Q9JIL5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Tulp4Q9JIL5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Tulp4Q9JIL5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Tulp4Q9JIL5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Tulp4Q9JIL5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Tulp4Q9JIL5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Tulp4Q9JIL5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Tulp4Q9JIL5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Tulp4Q9JIL5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Tulp4Q9JIL5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Tulp4Q9JIL5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Tulp4Q9JIL5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Tulp4Q9JIL5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Tulp4Q9JIL5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Tulp4Q9JIL5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Tulp4Q9JIL5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Tulp4Q9JIL5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Tulp4Q9JIL5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Tulp4Q9JIL5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Tulp4Q9JIL5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Tulp4Q9JIL5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Tulp4Q9JIL5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Tulp4Q9JIL5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Tulp4Q9JIL5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Tulp4Q9JIL5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Tulp4Q9JIL5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Tulp4Q9JIL5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Tulp4Q9JIL5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Tulp4Q9JIL5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Tulp4Q9JIL5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Tulp4Q9JIL5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Tulp4Q9JIL5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Tulp4Q9JIL5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Tulp4Q9JIL5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Tulp4Q9JIL5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Tulp4Q9JIL5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Tulp4Q9JIL5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Tulp4Q9JIL5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Tulp4Q9JIL5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tulp4Q9JIL5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tulp4Q9JIL5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tulp4Q9JIL5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Tulp4Q9JIL5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Tulp4Q9JIL5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Tulp4Q9JIL5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Tulp4Q9JIL5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Tulp4Q9JIL5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Tulp4Q9JIL5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Tulp4Q9JIL5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Tulp4Q9JIL5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Tulp4Q9JIL5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Tulp4Q9JIL5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Tulp4Q9JIL5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Tulp4Q9JIL5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Tulp4Q9JIL5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Tulp4Q9JIL5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Tulp4Q9JIL5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms