Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ddx21Q9JIK5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddx21Q9JIK5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx21Q9JIK5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx21Q9JIK5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Ddx21Q9JIK5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ddx21Q9JIK5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx21Q9JIK5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx21Q9JIK5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx21Q9JIK5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx21Q9JIK5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx21Q9JIK5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddx21Q9JIK5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddx21Q9JIK5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddx21Q9JIK5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddx21Q9JIK5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx21Q9JIK5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx21Q9JIK5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx21Q9JIK5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ddx21Q9JIK5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ddx21Q9JIK5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddx21Q9JIK5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx21Q9JIK5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ddx21Q9JIK5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ddx21Q9JIK5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ddx21Q9JIK5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddx21Q9JIK5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ddx21Q9JIK5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ddx21Q9JIK5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ddx21Q9JIK5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx21Q9JIK5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ddx21Q9JIK5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx21Q9JIK5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ddx21Q9JIK5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx21Q9JIK5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx21Q9JIK5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ddx21Q9JIK5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddx21Q9JIK5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddx21Q9JIK5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ddx21Q9JIK5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ddx21Q9JIK5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ddx21Q9JIK5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx21Q9JIK5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ddx21Q9JIK5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ddx21Q9JIK5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ddx21Q9JIK5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ddx21Q9JIK5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx21Q9JIK5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ddx21Q9JIK5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ddx21Q9JIK5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx21Q9JIK5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ddx21Q9JIK5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddx21Q9JIK5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ddx21Q9JIK5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx21Q9JIK5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx21Q9JIK5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx21Q9JIK5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ddx21Q9JIK5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddx21Q9JIK5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ddx21Q9JIK5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx21Q9JIK5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx21Q9JIK5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ddx21Q9JIK5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ddx21Q9JIK5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ddx21Q9JIK5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx21Q9JIK5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ddx21Q9JIK5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx21Q9JIK5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ddx21Q9JIK5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddx21Q9JIK5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ddx21Q9JIK5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx21Q9JIK5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ddx21Q9JIK5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ddx21Q9JIK5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ddx21Q9JIK5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddx21Q9JIK5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ddx21Q9JIK5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ddx21Q9JIK5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ddx21Q9JIK5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ddx21Q9JIK5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx21Q9JIK5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ddx21Q9JIK5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ddx21Q9JIK5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ddx21Q9JIK5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx21Q9JIK5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ddx21Q9JIK5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx21Q9JIK5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ddx21Q9JIK5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx21Q9JIK5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx21Q9JIK5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms