Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI33

Ntn4, Netrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn4Q9JI33 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ntn4Q9JI33 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ntn4Q9JI33 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ntn4Q9JI33 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ntn4Q9JI33 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ntn4Q9JI33 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ntn4Q9JI33 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ntn4Q9JI33 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ntn4Q9JI33 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ntn4Q9JI33 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ntn4Q9JI33 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ntn4Q9JI33 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ntn4Q9JI33 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ntn4Q9JI33 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ntn4Q9JI33 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ntn4Q9JI33 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ntn4Q9JI33 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ntn4Q9JI33 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ntn4Q9JI33 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ntn4Q9JI33 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ntn4Q9JI33 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ntn4Q9JI33 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ntn4Q9JI33 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ntn4Q9JI33 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ntn4Q9JI33 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ntn4Q9JI33 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ntn4Q9JI33 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ntn4Q9JI33 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ntn4Q9JI33 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ntn4Q9JI33 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ntn4Q9JI33 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ntn4Q9JI33 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ntn4Q9JI33 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ntn4Q9JI33 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ntn4Q9JI33 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ntn4Q9JI33 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ntn4Q9JI33 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ntn4Q9JI33 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ntn4Q9JI33 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ntn4Q9JI33 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ntn4Q9JI33 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ntn4Q9JI33 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ntn4Q9JI33 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ntn4Q9JI33 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ntn4Q9JI33 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ntn4Q9JI33 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ntn4Q9JI33 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ntn4Q9JI33 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ntn4Q9JI33 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ntn4Q9JI33 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ntn4Q9JI33 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ntn4Q9JI33 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ntn4Q9JI33 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ntn4Q9JI33 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ntn4Q9JI33 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms