Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cldn19Q9ET38 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cldn19Q9ET38 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cldn19Q9ET38 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cldn19Q9ET38 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cldn19Q9ET38 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cldn19Q9ET38 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cldn19Q9ET38 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cldn19Q9ET38 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cldn19Q9ET38 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cldn19Q9ET38 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cldn19Q9ET38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cldn19Q9ET38 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cldn19Q9ET38 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cldn19Q9ET38 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cldn19Q9ET38 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cldn19Q9ET38 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cldn19Q9ET38 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cldn19Q9ET38 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cldn19Q9ET38 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cldn19Q9ET38 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cldn19Q9ET38 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cldn19Q9ET38 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cldn19Q9ET38 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cldn19Q9ET38 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn19Q9ET38 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cldn19Q9ET38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cldn19Q9ET38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cldn19Q9ET38 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cldn19Q9ET38 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cldn19Q9ET38 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cldn19Q9ET38 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cldn19Q9ET38 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cldn19Q9ET38 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cldn19Q9ET38 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cldn19Q9ET38 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cldn19Q9ET38 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cldn19Q9ET38 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cldn19Q9ET38 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cldn19Q9ET38 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cldn19Q9ET38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cldn19Q9ET38 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cldn19Q9ET38 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cldn19Q9ET38 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cldn19Q9ET38 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cldn19Q9ET38 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cldn19Q9ET38 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cldn19Q9ET38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cldn19Q9ET38 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cldn19Q9ET38 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cldn19Q9ET38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cldn19Q9ET38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cldn19Q9ET38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cldn19Q9ET38 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cldn19Q9ET38 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cldn19Q9ET38 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn19Q9ET38 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn19Q9ET38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn19Q9ET38 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cldn19Q9ET38 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cldn19Q9ET38 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cldn19Q9ET38 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cldn19Q9ET38 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cldn19Q9ET38 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cldn19Q9ET38 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cldn19Q9ET38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cldn19Q9ET38 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cldn19Q9ET38 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cldn19Q9ET38 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn19Q9ET38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn19Q9ET38 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn19Q9ET38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cldn19Q9ET38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cldn19Q9ET38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cldn19Q9ET38 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn19Q9ET38 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cldn19Q9ET38 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn19Q9ET38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn19Q9ET38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn19Q9ET38 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cldn19Q9ET38 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cldn19Q9ET38 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn19Q9ET38 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn19Q9ET38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn19Q9ET38 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cldn19Q9ET38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
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