Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ0

Xpo4, Exportin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpo4Q9ESJ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Xpo4Q9ESJ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Xpo4Q9ESJ0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Xpo4Q9ESJ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Xpo4Q9ESJ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Xpo4Q9ESJ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Xpo4Q9ESJ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Xpo4Q9ESJ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Xpo4Q9ESJ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Xpo4Q9ESJ0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Xpo4Q9ESJ0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Xpo4Q9ESJ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Xpo4Q9ESJ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Xpo4Q9ESJ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Xpo4Q9ESJ0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Xpo4Q9ESJ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Xpo4Q9ESJ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Xpo4Q9ESJ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Xpo4Q9ESJ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Xpo4Q9ESJ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Xpo4Q9ESJ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Xpo4Q9ESJ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Xpo4Q9ESJ0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Xpo4Q9ESJ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Xpo4Q9ESJ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Xpo4Q9ESJ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Xpo4Q9ESJ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Xpo4Q9ESJ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Xpo4Q9ESJ0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Xpo4Q9ESJ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Xpo4Q9ESJ0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Xpo4Q9ESJ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Xpo4Q9ESJ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Xpo4Q9ESJ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Xpo4Q9ESJ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Xpo4Q9ESJ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Xpo4Q9ESJ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Xpo4Q9ESJ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Xpo4Q9ESJ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Xpo4Q9ESJ0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Xpo4Q9ESJ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Xpo4Q9ESJ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xpo4Q9ESJ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Xpo4Q9ESJ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Xpo4Q9ESJ0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Xpo4Q9ESJ0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Xpo4Q9ESJ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Xpo4Q9ESJ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Xpo4Q9ESJ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Xpo4Q9ESJ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xpo4Q9ESJ0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Xpo4Q9ESJ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Xpo4Q9ESJ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Xpo4Q9ESJ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Xpo4Q9ESJ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Xpo4Q9ESJ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Xpo4Q9ESJ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Xpo4Q9ESJ0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Xpo4Q9ESJ0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Xpo4Q9ESJ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Xpo4Q9ESJ0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Xpo4Q9ESJ0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Xpo4Q9ESJ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Xpo4Q9ESJ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Xpo4Q9ESJ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Xpo4Q9ESJ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Xpo4Q9ESJ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Xpo4Q9ESJ0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Xpo4Q9ESJ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Xpo4Q9ESJ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Xpo4Q9ESJ0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xpo4Q9ESJ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xpo4Q9ESJ0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xpo4Q9ESJ0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Xpo4Q9ESJ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Xpo4Q9ESJ0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Xpo4Q9ESJ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms