Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem27Q9ESG4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem27Q9ESG4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem27Q9ESG4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmem27Q9ESG4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem27Q9ESG4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem27Q9ESG4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem27Q9ESG4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem27Q9ESG4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem27Q9ESG4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem27Q9ESG4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem27Q9ESG4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem27Q9ESG4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem27Q9ESG4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem27Q9ESG4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem27Q9ESG4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem27Q9ESG4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem27Q9ESG4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem27Q9ESG4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem27Q9ESG4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem27Q9ESG4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem27Q9ESG4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem27Q9ESG4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem27Q9ESG4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem27Q9ESG4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem27Q9ESG4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem27Q9ESG4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem27Q9ESG4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem27Q9ESG4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem27Q9ESG4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem27Q9ESG4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem27Q9ESG4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem27Q9ESG4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem27Q9ESG4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem27Q9ESG4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem27Q9ESG4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem27Q9ESG4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem27Q9ESG4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem27Q9ESG4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem27Q9ESG4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem27Q9ESG4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem27Q9ESG4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem27Q9ESG4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem27Q9ESG4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem27Q9ESG4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem27Q9ESG4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem27Q9ESG4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem27Q9ESG4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem27Q9ESG4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem27Q9ESG4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmem27Q9ESG4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem27Q9ESG4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem27Q9ESG4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem27Q9ESG4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem27Q9ESG4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem27Q9ESG4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem27Q9ESG4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem27Q9ESG4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem27Q9ESG4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem27Q9ESG4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem27Q9ESG4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem27Q9ESG4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem27Q9ESG4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms