Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER73

Elp4, Elongator complex protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp4Q9ER73 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Elp4Q9ER73 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Elp4Q9ER73 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Elp4Q9ER73 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Elp4Q9ER73 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Elp4Q9ER73 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Elp4Q9ER73 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Elp4Q9ER73 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Elp4Q9ER73 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp4Q9ER73 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp4Q9ER73 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Elp4Q9ER73 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Elp4Q9ER73 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Elp4Q9ER73 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Elp4Q9ER73 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Elp4Q9ER73 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp4Q9ER73 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Elp4Q9ER73 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Elp4Q9ER73 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Elp4Q9ER73 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elp4Q9ER73 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Elp4Q9ER73 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Elp4Q9ER73 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Elp4Q9ER73 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Elp4Q9ER73 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Elp4Q9ER73 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elp4Q9ER73 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elp4Q9ER73 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elp4Q9ER73 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp4Q9ER73 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp4Q9ER73 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elp4Q9ER73 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elp4Q9ER73 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elp4Q9ER73 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elp4Q9ER73 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp4Q9ER73 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elp4Q9ER73 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elp4Q9ER73 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Elp4Q9ER73 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elp4Q9ER73 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp4Q9ER73 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp4Q9ER73 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp4Q9ER73 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp4Q9ER73 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp4Q9ER73 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elp4Q9ER73 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Elp4Q9ER73 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elp4Q9ER73 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elp4Q9ER73 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elp4Q9ER73 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Elp4Q9ER73 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elp4Q9ER73 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Elp4Q9ER73 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp4Q9ER73 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Elp4Q9ER73 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elp4Q9ER73 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Elp4Q9ER73 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Elp4Q9ER73 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Elp4Q9ER73 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Elp4Q9ER73 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Elp4Q9ER73 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Elp4Q9ER73 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp4Q9ER73 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp4Q9ER73 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Elp4Q9ER73 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Elp4Q9ER73 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Elp4Q9ER73 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Elp4Q9ER73 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elp4Q9ER73 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elp4Q9ER73 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elp4Q9ER73 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elp4Q9ER73 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elp4Q9ER73 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.4 ms