Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cpne8Q9DC53 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cpne8Q9DC53 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cpne8Q9DC53 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cpne8Q9DC53 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cpne8Q9DC53 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cpne8Q9DC53 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpne8Q9DC53 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cpne8Q9DC53 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cpne8Q9DC53 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cpne8Q9DC53 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cpne8Q9DC53 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpne8Q9DC53 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpne8Q9DC53 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpne8Q9DC53 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpne8Q9DC53 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpne8Q9DC53 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpne8Q9DC53 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cpne8Q9DC53 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpne8Q9DC53 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cpne8Q9DC53 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cpne8Q9DC53 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cpne8Q9DC53 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cpne8Q9DC53 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cpne8Q9DC53 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cpne8Q9DC53 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cpne8Q9DC53 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cpne8Q9DC53 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cpne8Q9DC53 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cpne8Q9DC53 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cpne8Q9DC53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cpne8Q9DC53 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cpne8Q9DC53 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cpne8Q9DC53 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cpne8Q9DC53 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cpne8Q9DC53 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cpne8Q9DC53 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cpne8Q9DC53 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cpne8Q9DC53 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cpne8Q9DC53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cpne8Q9DC53 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cpne8Q9DC53 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cpne8Q9DC53 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cpne8Q9DC53 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cpne8Q9DC53 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cpne8Q9DC53 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cpne8Q9DC53 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cpne8Q9DC53 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpne8Q9DC53 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpne8Q9DC53 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cpne8Q9DC53 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cpne8Q9DC53 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cpne8Q9DC53 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cpne8Q9DC53 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cpne8Q9DC53 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpne8Q9DC53 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpne8Q9DC53 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpne8Q9DC53 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpne8Q9DC53 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpne8Q9DC53 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpne8Q9DC53 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpne8Q9DC53 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpne8Q9DC53 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpne8Q9DC53 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cpne8Q9DC53 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cpne8Q9DC53 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpne8Q9DC53 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpne8Q9DC53 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpne8Q9DC53 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpne8Q9DC53 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpne8Q9DC53 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpne8Q9DC53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpne8Q9DC53 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpne8Q9DC53 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpne8Q9DC53 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpne8Q9DC53 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpne8Q9DC53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpne8Q9DC53 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpne8Q9DC53 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpne8Q9DC53 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms