Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Syde1Q9DBZ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Syde1Q9DBZ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syde1Q9DBZ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syde1Q9DBZ9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syde1Q9DBZ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Syde1Q9DBZ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Syde1Q9DBZ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Syde1Q9DBZ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Syde1Q9DBZ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Syde1Q9DBZ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Syde1Q9DBZ9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syde1Q9DBZ9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Syde1Q9DBZ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syde1Q9DBZ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syde1Q9DBZ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Syde1Q9DBZ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Syde1Q9DBZ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Syde1Q9DBZ9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Syde1Q9DBZ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Syde1Q9DBZ9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Syde1Q9DBZ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Syde1Q9DBZ9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Syde1Q9DBZ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Syde1Q9DBZ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syde1Q9DBZ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syde1Q9DBZ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Syde1Q9DBZ9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syde1Q9DBZ9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syde1Q9DBZ9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syde1Q9DBZ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Syde1Q9DBZ9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syde1Q9DBZ9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syde1Q9DBZ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syde1Q9DBZ9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syde1Q9DBZ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syde1Q9DBZ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syde1Q9DBZ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syde1Q9DBZ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syde1Q9DBZ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syde1Q9DBZ9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Syde1Q9DBZ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syde1Q9DBZ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Syde1Q9DBZ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syde1Q9DBZ9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Syde1Q9DBZ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Syde1Q9DBZ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syde1Q9DBZ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Syde1Q9DBZ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syde1Q9DBZ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syde1Q9DBZ9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Syde1Q9DBZ9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syde1Q9DBZ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syde1Q9DBZ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syde1Q9DBZ9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syde1Q9DBZ9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syde1Q9DBZ9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syde1Q9DBZ9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syde1Q9DBZ9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syde1Q9DBZ9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syde1Q9DBZ9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syde1Q9DBZ9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syde1Q9DBZ9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syde1Q9DBZ9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syde1Q9DBZ9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syde1Q9DBZ9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syde1Q9DBZ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syde1Q9DBZ9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde1Q9DBZ9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syde1Q9DBZ9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syde1Q9DBZ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syde1Q9DBZ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syde1Q9DBZ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syde1Q9DBZ9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syde1Q9DBZ9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Syde1Q9DBZ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syde1Q9DBZ9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syde1Q9DBZ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Syde1Q9DBZ9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syde1Q9DBZ9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syde1Q9DBZ9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syde1Q9DBZ9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syde1Q9DBZ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syde1Q9DBZ9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syde1Q9DBZ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syde1Q9DBZ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Syde1Q9DBZ9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde1Q9DBZ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syde1Q9DBZ9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms