Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf654Q9DAU9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf654Q9DAU9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf654Q9DAU9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf654Q9DAU9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf654Q9DAU9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf654Q9DAU9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf654Q9DAU9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf654Q9DAU9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf654Q9DAU9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znf654Q9DAU9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Znf654Q9DAU9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Znf654Q9DAU9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Znf654Q9DAU9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf654Q9DAU9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf654Q9DAU9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf654Q9DAU9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Znf654Q9DAU9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Znf654Q9DAU9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Znf654Q9DAU9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Znf654Q9DAU9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf654Q9DAU9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Znf654Q9DAU9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf654Q9DAU9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Znf654Q9DAU9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf654Q9DAU9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf654Q9DAU9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf654Q9DAU9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf654Q9DAU9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf654Q9DAU9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf654Q9DAU9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf654Q9DAU9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf654Q9DAU9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf654Q9DAU9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf654Q9DAU9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf654Q9DAU9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf654Q9DAU9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf654Q9DAU9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf654Q9DAU9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf654Q9DAU9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf654Q9DAU9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf654Q9DAU9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf654Q9DAU9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf654Q9DAU9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf654Q9DAU9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf654Q9DAU9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf654Q9DAU9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf654Q9DAU9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf654Q9DAU9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf654Q9DAU9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Znf654Q9DAU9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf654Q9DAU9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf654Q9DAU9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf654Q9DAU9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf654Q9DAU9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf654Q9DAU9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf654Q9DAU9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf654Q9DAU9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf654Q9DAU9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf654Q9DAU9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf654Q9DAU9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf654Q9DAU9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf654Q9DAU9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf654Q9DAU9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf654Q9DAU9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf654Q9DAU9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znf654Q9DAU9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf654Q9DAU9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf654Q9DAU9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf654Q9DAU9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf654Q9DAU9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf654Q9DAU9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf654Q9DAU9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Znf654Q9DAU9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms