Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Speer4bQ9D9F7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Speer4bQ9D9F7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Speer4bQ9D9F7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Speer4bQ9D9F7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Speer4bQ9D9F7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Speer4bQ9D9F7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Speer4bQ9D9F7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Speer4bQ9D9F7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Speer4bQ9D9F7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Speer4bQ9D9F7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Speer4bQ9D9F7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Speer4bQ9D9F7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Speer4bQ9D9F7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Speer4bQ9D9F7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Speer4bQ9D9F7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Speer4bQ9D9F7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Speer4bQ9D9F7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Speer4bQ9D9F7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Speer4bQ9D9F7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Speer4bQ9D9F7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Speer4bQ9D9F7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Speer4bQ9D9F7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Speer4bQ9D9F7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Speer4bQ9D9F7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Speer4bQ9D9F7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Speer4bQ9D9F7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Speer4bQ9D9F7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Speer4bQ9D9F7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Speer4bQ9D9F7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Speer4bQ9D9F7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Speer4bQ9D9F7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Speer4bQ9D9F7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Speer4bQ9D9F7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Speer4bQ9D9F7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Speer4bQ9D9F7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Speer4bQ9D9F7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Speer4bQ9D9F7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Speer4bQ9D9F7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Speer4bQ9D9F7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Speer4bQ9D9F7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Speer4bQ9D9F7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Speer4bQ9D9F7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Speer4bQ9D9F7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Speer4bQ9D9F7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Speer4bQ9D9F7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Speer4bQ9D9F7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Speer4bQ9D9F7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Speer4bQ9D9F7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Speer4bQ9D9F7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Speer4bQ9D9F7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Speer4bQ9D9F7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Speer4bQ9D9F7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Speer4bQ9D9F7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Speer4bQ9D9F7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Speer4bQ9D9F7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Speer4bQ9D9F7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Speer4bQ9D9F7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Speer4bQ9D9F7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Speer4bQ9D9F7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Speer4bQ9D9F7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Speer4bQ9D9F7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Speer4bQ9D9F7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Speer4bQ9D9F7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Speer4bQ9D9F7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Speer4bQ9D9F7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Speer4bQ9D9F7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Speer4bQ9D9F7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Speer4bQ9D9F7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Speer4bQ9D9F7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Speer4bQ9D9F7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Speer4bQ9D9F7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Speer4bQ9D9F7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Speer4bQ9D9F7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Speer4bQ9D9F7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Speer4bQ9D9F7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Speer4bQ9D9F7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Speer4bQ9D9F7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Speer4bQ9D9F7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Speer4bQ9D9F7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Speer4bQ9D9F7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Speer4bQ9D9F7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Speer4bQ9D9F7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Speer4bQ9D9F7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Speer4bQ9D9F7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Speer4bQ9D9F7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Speer4bQ9D9F7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Speer4bQ9D9F7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Speer4bQ9D9F7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Speer4bQ9D9F7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Speer4bQ9D9F7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Speer4bQ9D9F7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Speer4bQ9D9F7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Speer4bQ9D9F7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Speer4bQ9D9F7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Speer4bQ9D9F7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Speer4bQ9D9F7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Speer4bQ9D9F7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Speer4bQ9D9F7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms