Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Z6

Atg101, Autophagy-related protein 101, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg101Q9D8Z6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg101Q9D8Z6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg101Q9D8Z6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg101Q9D8Z6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg101Q9D8Z6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg101Q9D8Z6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg101Q9D8Z6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg101Q9D8Z6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg101Q9D8Z6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg101Q9D8Z6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg101Q9D8Z6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg101Q9D8Z6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg101Q9D8Z6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg101Q9D8Z6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atg101Q9D8Z6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atg101Q9D8Z6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg101Q9D8Z6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atg101Q9D8Z6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atg101Q9D8Z6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atg101Q9D8Z6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg101Q9D8Z6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atg101Q9D8Z6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg101Q9D8Z6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atg101Q9D8Z6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg101Q9D8Z6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atg101Q9D8Z6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Atg101Q9D8Z6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg101Q9D8Z6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg101Q9D8Z6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg101Q9D8Z6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg101Q9D8Z6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg101Q9D8Z6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg101Q9D8Z6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg101Q9D8Z6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg101Q9D8Z6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Atg101Q9D8Z6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg101Q9D8Z6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg101Q9D8Z6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg101Q9D8Z6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg101Q9D8Z6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg101Q9D8Z6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg101Q9D8Z6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg101Q9D8Z6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg101Q9D8Z6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg101Q9D8Z6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg101Q9D8Z6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg101Q9D8Z6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg101Q9D8Z6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atg101Q9D8Z6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg101Q9D8Z6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atg101Q9D8Z6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atg101Q9D8Z6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg101Q9D8Z6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atg101Q9D8Z6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg101Q9D8Z6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg101Q9D8Z6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg101Q9D8Z6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg101Q9D8Z6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg101Q9D8Z6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms