Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Alkbh4Q9D8F1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Alkbh4Q9D8F1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Alkbh4Q9D8F1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Alkbh4Q9D8F1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Alkbh4Q9D8F1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Alkbh4Q9D8F1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Alkbh4Q9D8F1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Alkbh4Q9D8F1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Alkbh4Q9D8F1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Alkbh4Q9D8F1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Alkbh4Q9D8F1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Alkbh4Q9D8F1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Alkbh4Q9D8F1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Alkbh4Q9D8F1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Alkbh4Q9D8F1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Alkbh4Q9D8F1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Alkbh4Q9D8F1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Alkbh4Q9D8F1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Alkbh4Q9D8F1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Alkbh4Q9D8F1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Alkbh4Q9D8F1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Alkbh4Q9D8F1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Alkbh4Q9D8F1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Alkbh4Q9D8F1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh4Q9D8F1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Alkbh4Q9D8F1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Alkbh4Q9D8F1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh4Q9D8F1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alkbh4Q9D8F1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh4Q9D8F1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alkbh4Q9D8F1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alkbh4Q9D8F1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alkbh4Q9D8F1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alkbh4Q9D8F1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alkbh4Q9D8F1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh4Q9D8F1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alkbh4Q9D8F1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alkbh4Q9D8F1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Alkbh4Q9D8F1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Alkbh4Q9D8F1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh4Q9D8F1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Alkbh4Q9D8F1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Alkbh4Q9D8F1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh4Q9D8F1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh4Q9D8F1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Alkbh4Q9D8F1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Alkbh4Q9D8F1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Alkbh4Q9D8F1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh4Q9D8F1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Alkbh4Q9D8F1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Alkbh4Q9D8F1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Alkbh4Q9D8F1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh4Q9D8F1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh4Q9D8F1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Alkbh4Q9D8F1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh4Q9D8F1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Alkbh4Q9D8F1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh4Q9D8F1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Alkbh4Q9D8F1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Alkbh4Q9D8F1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Alkbh4Q9D8F1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Alkbh4Q9D8F1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh4Q9D8F1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh4Q9D8F1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh4Q9D8F1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Alkbh4Q9D8F1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh4Q9D8F1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Alkbh4Q9D8F1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Alkbh4Q9D8F1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Alkbh4Q9D8F1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Alkbh4Q9D8F1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Alkbh4Q9D8F1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alkbh4Q9D8F1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alkbh4Q9D8F1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Alkbh4Q9D8F1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alkbh4Q9D8F1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alkbh4Q9D8F1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Alkbh4Q9D8F1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Alkbh4Q9D8F1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Alkbh4Q9D8F1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms