Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp6v1e2Q9D593 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Atp6v1e2Q9D593 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp6v1e2Q9D593 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp6v1e2Q9D593 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atp6v1e2Q9D593 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atp6v1e2Q9D593 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atp6v1e2Q9D593 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp6v1e2Q9D593 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atp6v1e2Q9D593 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp6v1e2Q9D593 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Atp6v1e2Q9D593 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp6v1e2Q9D593 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atp6v1e2Q9D593 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atp6v1e2Q9D593 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp6v1e2Q9D593 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp6v1e2Q9D593 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp6v1e2Q9D593 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp6v1e2Q9D593 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp6v1e2Q9D593 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atp6v1e2Q9D593 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp6v1e2Q9D593 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp6v1e2Q9D593 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp6v1e2Q9D593 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp6v1e2Q9D593 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp6v1e2Q9D593 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp6v1e2Q9D593 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atp6v1e2Q9D593 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp6v1e2Q9D593 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp6v1e2Q9D593 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp6v1e2Q9D593 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp6v1e2Q9D593 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp6v1e2Q9D593 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp6v1e2Q9D593 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp6v1e2Q9D593 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp6v1e2Q9D593 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp6v1e2Q9D593 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp6v1e2Q9D593 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp6v1e2Q9D593 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp6v1e2Q9D593 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp6v1e2Q9D593 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp6v1e2Q9D593 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp6v1e2Q9D593 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp6v1e2Q9D593 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp6v1e2Q9D593 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp6v1e2Q9D593 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Atp6v1e2Q9D593 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp6v1e2Q9D593 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Atp6v1e2Q9D593 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp6v1e2Q9D593 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp6v1e2Q9D593 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp6v1e2Q9D593 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp6v1e2Q9D593 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp6v1e2Q9D593 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp6v1e2Q9D593 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp6v1e2Q9D593 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp6v1e2Q9D593 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp6v1e2Q9D593 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp6v1e2Q9D593 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp6v1e2Q9D593 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp6v1e2Q9D593 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp6v1e2Q9D593 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp6v1e2Q9D593 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp6v1e2Q9D593 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp6v1e2Q9D593 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp6v1e2Q9D593 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atp6v1e2Q9D593 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp6v1e2Q9D593 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp6v1e2Q9D593 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp6v1e2Q9D593 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp6v1e2Q9D593 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp6v1e2Q9D593 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp6v1e2Q9D593 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp6v1e2Q9D593 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp6v1e2Q9D593 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms