Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clvs1Q9D4C9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Clvs1Q9D4C9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clvs1Q9D4C9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clvs1Q9D4C9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clvs1Q9D4C9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clvs1Q9D4C9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clvs1Q9D4C9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clvs1Q9D4C9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clvs1Q9D4C9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clvs1Q9D4C9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clvs1Q9D4C9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clvs1Q9D4C9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clvs1Q9D4C9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clvs1Q9D4C9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clvs1Q9D4C9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clvs1Q9D4C9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clvs1Q9D4C9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clvs1Q9D4C9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clvs1Q9D4C9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clvs1Q9D4C9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clvs1Q9D4C9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clvs1Q9D4C9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clvs1Q9D4C9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clvs1Q9D4C9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clvs1Q9D4C9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clvs1Q9D4C9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clvs1Q9D4C9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clvs1Q9D4C9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clvs1Q9D4C9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clvs1Q9D4C9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clvs1Q9D4C9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clvs1Q9D4C9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clvs1Q9D4C9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Clvs1Q9D4C9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clvs1Q9D4C9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clvs1Q9D4C9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clvs1Q9D4C9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clvs1Q9D4C9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Clvs1Q9D4C9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clvs1Q9D4C9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clvs1Q9D4C9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clvs1Q9D4C9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clvs1Q9D4C9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clvs1Q9D4C9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clvs1Q9D4C9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clvs1Q9D4C9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clvs1Q9D4C9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clvs1Q9D4C9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clvs1Q9D4C9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clvs1Q9D4C9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clvs1Q9D4C9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clvs1Q9D4C9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clvs1Q9D4C9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clvs1Q9D4C9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clvs1Q9D4C9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clvs1Q9D4C9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clvs1Q9D4C9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms