Protein–RNA interactions for Protein: Q9D411

Tssk4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk4Q9D411 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tssk4Q9D411 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tssk4Q9D411 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tssk4Q9D411 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tssk4Q9D411 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tssk4Q9D411 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tssk4Q9D411 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tssk4Q9D411 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tssk4Q9D411 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tssk4Q9D411 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tssk4Q9D411 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tssk4Q9D411 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tssk4Q9D411 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tssk4Q9D411 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tssk4Q9D411 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tssk4Q9D411 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tssk4Q9D411 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tssk4Q9D411 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tssk4Q9D411 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tssk4Q9D411 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tssk4Q9D411 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tssk4Q9D411 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tssk4Q9D411 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tssk4Q9D411 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tssk4Q9D411 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tssk4Q9D411 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tssk4Q9D411 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tssk4Q9D411 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tssk4Q9D411 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tssk4Q9D411 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tssk4Q9D411 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tssk4Q9D411 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tssk4Q9D411 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tssk4Q9D411 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tssk4Q9D411 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tssk4Q9D411 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tssk4Q9D411 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tssk4Q9D411 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tssk4Q9D411 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tssk4Q9D411 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tssk4Q9D411 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tssk4Q9D411 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tssk4Q9D411 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tssk4Q9D411 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tssk4Q9D411 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tssk4Q9D411 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tssk4Q9D411 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tssk4Q9D411 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tssk4Q9D411 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tssk4Q9D411 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tssk4Q9D411 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms