Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X5

Pacrgl, PACRG-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrglQ9D3X5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PacrglQ9D3X5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PacrglQ9D3X5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PacrglQ9D3X5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PacrglQ9D3X5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PacrglQ9D3X5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PacrglQ9D3X5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PacrglQ9D3X5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PacrglQ9D3X5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PacrglQ9D3X5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PacrglQ9D3X5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PacrglQ9D3X5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PacrglQ9D3X5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PacrglQ9D3X5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PacrglQ9D3X5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PacrglQ9D3X5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PacrglQ9D3X5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PacrglQ9D3X5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PacrglQ9D3X5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PacrglQ9D3X5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PacrglQ9D3X5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PacrglQ9D3X5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PacrglQ9D3X5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PacrglQ9D3X5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PacrglQ9D3X5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PacrglQ9D3X5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PacrglQ9D3X5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PacrglQ9D3X5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PacrglQ9D3X5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PacrglQ9D3X5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PacrglQ9D3X5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PacrglQ9D3X5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PacrglQ9D3X5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PacrglQ9D3X5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PacrglQ9D3X5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PacrglQ9D3X5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PacrglQ9D3X5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PacrglQ9D3X5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PacrglQ9D3X5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PacrglQ9D3X5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PacrglQ9D3X5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PacrglQ9D3X5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PacrglQ9D3X5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PacrglQ9D3X5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PacrglQ9D3X5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PacrglQ9D3X5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PacrglQ9D3X5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PacrglQ9D3X5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PacrglQ9D3X5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PacrglQ9D3X5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PacrglQ9D3X5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PacrglQ9D3X5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PacrglQ9D3X5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PacrglQ9D3X5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PacrglQ9D3X5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PacrglQ9D3X5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PacrglQ9D3X5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PacrglQ9D3X5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PacrglQ9D3X5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PacrglQ9D3X5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PacrglQ9D3X5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PacrglQ9D3X5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PacrglQ9D3X5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PacrglQ9D3X5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PacrglQ9D3X5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PacrglQ9D3X5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PacrglQ9D3X5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms