Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx20Q9D2Y5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx20Q9D2Y5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx20Q9D2Y5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx20Q9D2Y5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx20Q9D2Y5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx20Q9D2Y5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx20Q9D2Y5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx20Q9D2Y5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx20Q9D2Y5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx20Q9D2Y5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx20Q9D2Y5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx20Q9D2Y5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx20Q9D2Y5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx20Q9D2Y5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snx20Q9D2Y5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx20Q9D2Y5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx20Q9D2Y5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx20Q9D2Y5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx20Q9D2Y5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx20Q9D2Y5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx20Q9D2Y5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx20Q9D2Y5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx20Q9D2Y5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx20Q9D2Y5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx20Q9D2Y5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx20Q9D2Y5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx20Q9D2Y5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx20Q9D2Y5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx20Q9D2Y5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx20Q9D2Y5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx20Q9D2Y5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx20Q9D2Y5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx20Q9D2Y5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx20Q9D2Y5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx20Q9D2Y5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx20Q9D2Y5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx20Q9D2Y5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx20Q9D2Y5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx20Q9D2Y5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx20Q9D2Y5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx20Q9D2Y5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx20Q9D2Y5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx20Q9D2Y5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx20Q9D2Y5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx20Q9D2Y5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snx20Q9D2Y5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx20Q9D2Y5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx20Q9D2Y5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx20Q9D2Y5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx20Q9D2Y5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx20Q9D2Y5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx20Q9D2Y5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx20Q9D2Y5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx20Q9D2Y5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx20Q9D2Y5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx20Q9D2Y5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx20Q9D2Y5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx20Q9D2Y5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx20Q9D2Y5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx20Q9D2Y5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx20Q9D2Y5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx20Q9D2Y5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx20Q9D2Y5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx20Q9D2Y5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx20Q9D2Y5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx20Q9D2Y5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx20Q9D2Y5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx20Q9D2Y5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx20Q9D2Y5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx20Q9D2Y5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx20Q9D2Y5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx20Q9D2Y5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx20Q9D2Y5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx20Q9D2Y5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx20Q9D2Y5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx20Q9D2Y5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx20Q9D2Y5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx20Q9D2Y5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx20Q9D2Y5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx20Q9D2Y5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx20Q9D2Y5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx20Q9D2Y5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms