Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chordc1Q9D1P4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chordc1Q9D1P4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chordc1Q9D1P4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chordc1Q9D1P4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chordc1Q9D1P4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chordc1Q9D1P4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chordc1Q9D1P4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chordc1Q9D1P4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chordc1Q9D1P4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chordc1Q9D1P4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chordc1Q9D1P4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Chordc1Q9D1P4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chordc1Q9D1P4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chordc1Q9D1P4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Chordc1Q9D1P4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Chordc1Q9D1P4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chordc1Q9D1P4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Chordc1Q9D1P4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Chordc1Q9D1P4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Chordc1Q9D1P4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Chordc1Q9D1P4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chordc1Q9D1P4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Chordc1Q9D1P4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chordc1Q9D1P4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chordc1Q9D1P4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chordc1Q9D1P4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chordc1Q9D1P4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chordc1Q9D1P4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chordc1Q9D1P4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Chordc1Q9D1P4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Chordc1Q9D1P4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chordc1Q9D1P4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Chordc1Q9D1P4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chordc1Q9D1P4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Chordc1Q9D1P4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chordc1Q9D1P4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chordc1Q9D1P4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chordc1Q9D1P4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chordc1Q9D1P4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chordc1Q9D1P4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Chordc1Q9D1P4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chordc1Q9D1P4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chordc1Q9D1P4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chordc1Q9D1P4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chordc1Q9D1P4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Chordc1Q9D1P4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chordc1Q9D1P4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chordc1Q9D1P4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chordc1Q9D1P4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chordc1Q9D1P4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chordc1Q9D1P4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chordc1Q9D1P4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chordc1Q9D1P4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chordc1Q9D1P4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chordc1Q9D1P4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chordc1Q9D1P4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chordc1Q9D1P4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chordc1Q9D1P4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chordc1Q9D1P4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Chordc1Q9D1P4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Chordc1Q9D1P4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Chordc1Q9D1P4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chordc1Q9D1P4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Chordc1Q9D1P4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Chordc1Q9D1P4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chordc1Q9D1P4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chordc1Q9D1P4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Chordc1Q9D1P4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chordc1Q9D1P4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chordc1Q9D1P4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chordc1Q9D1P4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chordc1Q9D1P4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chordc1Q9D1P4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chordc1Q9D1P4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chordc1Q9D1P4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chordc1Q9D1P4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms