Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cthrc1Q9D1D6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cthrc1Q9D1D6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cthrc1Q9D1D6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cthrc1Q9D1D6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cthrc1Q9D1D6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cthrc1Q9D1D6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cthrc1Q9D1D6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cthrc1Q9D1D6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cthrc1Q9D1D6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cthrc1Q9D1D6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cthrc1Q9D1D6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cthrc1Q9D1D6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cthrc1Q9D1D6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cthrc1Q9D1D6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cthrc1Q9D1D6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cthrc1Q9D1D6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cthrc1Q9D1D6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cthrc1Q9D1D6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cthrc1Q9D1D6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cthrc1Q9D1D6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cthrc1Q9D1D6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cthrc1Q9D1D6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cthrc1Q9D1D6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cthrc1Q9D1D6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cthrc1Q9D1D6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cthrc1Q9D1D6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cthrc1Q9D1D6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cthrc1Q9D1D6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cthrc1Q9D1D6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cthrc1Q9D1D6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cthrc1Q9D1D6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cthrc1Q9D1D6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cthrc1Q9D1D6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cthrc1Q9D1D6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cthrc1Q9D1D6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cthrc1Q9D1D6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cthrc1Q9D1D6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cthrc1Q9D1D6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cthrc1Q9D1D6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cthrc1Q9D1D6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cthrc1Q9D1D6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cthrc1Q9D1D6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cthrc1Q9D1D6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cthrc1Q9D1D6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cthrc1Q9D1D6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cthrc1Q9D1D6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cthrc1Q9D1D6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cthrc1Q9D1D6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cthrc1Q9D1D6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cthrc1Q9D1D6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cthrc1Q9D1D6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cthrc1Q9D1D6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cthrc1Q9D1D6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms