Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Stx17Q9D0I4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Stx17Q9D0I4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stx17Q9D0I4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stx17Q9D0I4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stx17Q9D0I4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stx17Q9D0I4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stx17Q9D0I4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stx17Q9D0I4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stx17Q9D0I4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stx17Q9D0I4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stx17Q9D0I4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stx17Q9D0I4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Stx17Q9D0I4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stx17Q9D0I4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx17Q9D0I4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx17Q9D0I4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stx17Q9D0I4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stx17Q9D0I4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stx17Q9D0I4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stx17Q9D0I4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stx17Q9D0I4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stx17Q9D0I4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stx17Q9D0I4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stx17Q9D0I4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stx17Q9D0I4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stx17Q9D0I4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stx17Q9D0I4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stx17Q9D0I4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stx17Q9D0I4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stx17Q9D0I4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stx17Q9D0I4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stx17Q9D0I4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Stx17Q9D0I4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stx17Q9D0I4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Stx17Q9D0I4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stx17Q9D0I4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Stx17Q9D0I4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stx17Q9D0I4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx17Q9D0I4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stx17Q9D0I4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stx17Q9D0I4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Stx17Q9D0I4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stx17Q9D0I4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Stx17Q9D0I4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stx17Q9D0I4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stx17Q9D0I4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stx17Q9D0I4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Stx17Q9D0I4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stx17Q9D0I4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stx17Q9D0I4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Stx17Q9D0I4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stx17Q9D0I4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stx17Q9D0I4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx17Q9D0I4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx17Q9D0I4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Stx17Q9D0I4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stx17Q9D0I4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stx17Q9D0I4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stx17Q9D0I4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stx17Q9D0I4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stx17Q9D0I4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx17Q9D0I4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx17Q9D0I4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx17Q9D0I4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stx17Q9D0I4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stx17Q9D0I4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stx17Q9D0I4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx17Q9D0I4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stx17Q9D0I4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx17Q9D0I4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stx17Q9D0I4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stx17Q9D0I4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stx17Q9D0I4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx17Q9D0I4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stx17Q9D0I4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Stx17Q9D0I4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stx17Q9D0I4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stx17Q9D0I4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms