Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shmt2Q9CZN7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shmt2Q9CZN7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shmt2Q9CZN7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shmt2Q9CZN7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shmt2Q9CZN7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Shmt2Q9CZN7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shmt2Q9CZN7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shmt2Q9CZN7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shmt2Q9CZN7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shmt2Q9CZN7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shmt2Q9CZN7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shmt2Q9CZN7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Shmt2Q9CZN7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Shmt2Q9CZN7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Shmt2Q9CZN7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Shmt2Q9CZN7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Shmt2Q9CZN7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Shmt2Q9CZN7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Shmt2Q9CZN7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Shmt2Q9CZN7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Shmt2Q9CZN7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shmt2Q9CZN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shmt2Q9CZN7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Shmt2Q9CZN7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Shmt2Q9CZN7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Shmt2Q9CZN7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shmt2Q9CZN7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shmt2Q9CZN7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shmt2Q9CZN7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shmt2Q9CZN7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Shmt2Q9CZN7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shmt2Q9CZN7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shmt2Q9CZN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shmt2Q9CZN7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shmt2Q9CZN7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shmt2Q9CZN7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Shmt2Q9CZN7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Shmt2Q9CZN7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Shmt2Q9CZN7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Shmt2Q9CZN7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Shmt2Q9CZN7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Shmt2Q9CZN7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shmt2Q9CZN7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Shmt2Q9CZN7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Shmt2Q9CZN7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Shmt2Q9CZN7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Shmt2Q9CZN7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Shmt2Q9CZN7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shmt2Q9CZN7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Shmt2Q9CZN7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Shmt2Q9CZN7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Shmt2Q9CZN7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shmt2Q9CZN7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Shmt2Q9CZN7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shmt2Q9CZN7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shmt2Q9CZN7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shmt2Q9CZN7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shmt2Q9CZN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Shmt2Q9CZN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Shmt2Q9CZN7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Shmt2Q9CZN7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms