Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA5

Zcchc12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc12Q9CZA5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc12Q9CZA5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc12Q9CZA5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zcchc12Q9CZA5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc12Q9CZA5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zcchc12Q9CZA5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zcchc12Q9CZA5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc12Q9CZA5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc12Q9CZA5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zcchc12Q9CZA5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zcchc12Q9CZA5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc12Q9CZA5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zcchc12Q9CZA5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zcchc12Q9CZA5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zcchc12Q9CZA5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zcchc12Q9CZA5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zcchc12Q9CZA5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc12Q9CZA5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Zcchc12Q9CZA5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc12Q9CZA5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc12Q9CZA5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc12Q9CZA5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc12Q9CZA5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc12Q9CZA5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc12Q9CZA5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc12Q9CZA5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc12Q9CZA5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc12Q9CZA5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc12Q9CZA5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc12Q9CZA5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zcchc12Q9CZA5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc12Q9CZA5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc12Q9CZA5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc12Q9CZA5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc12Q9CZA5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zcchc12Q9CZA5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc12Q9CZA5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc12Q9CZA5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zcchc12Q9CZA5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zcchc12Q9CZA5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc12Q9CZA5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zcchc12Q9CZA5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zcchc12Q9CZA5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Zcchc12Q9CZA5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc12Q9CZA5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc12Q9CZA5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc12Q9CZA5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc12Q9CZA5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc12Q9CZA5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc12Q9CZA5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc12Q9CZA5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zcchc12Q9CZA5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zcchc12Q9CZA5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zcchc12Q9CZA5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zcchc12Q9CZA5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc12Q9CZA5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc12Q9CZA5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc12Q9CZA5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc12Q9CZA5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc12Q9CZA5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc12Q9CZA5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc12Q9CZA5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc12Q9CZA5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc12Q9CZA5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc12Q9CZA5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc12Q9CZA5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc12Q9CZA5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc12Q9CZA5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc12Q9CZA5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc12Q9CZA5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc12Q9CZA5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms