Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klhl35Q9CZ49 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klhl35Q9CZ49 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Klhl35Q9CZ49 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Klhl35Q9CZ49 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klhl35Q9CZ49 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Klhl35Q9CZ49 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl35Q9CZ49 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl35Q9CZ49 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Klhl35Q9CZ49 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Klhl35Q9CZ49 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Klhl35Q9CZ49 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Klhl35Q9CZ49 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Klhl35Q9CZ49 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Klhl35Q9CZ49 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Klhl35Q9CZ49 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Klhl35Q9CZ49 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klhl35Q9CZ49 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klhl35Q9CZ49 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klhl35Q9CZ49 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Klhl35Q9CZ49 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klhl35Q9CZ49 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klhl35Q9CZ49 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klhl35Q9CZ49 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl35Q9CZ49 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl35Q9CZ49 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Klhl35Q9CZ49 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl35Q9CZ49 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl35Q9CZ49 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl35Q9CZ49 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhl35Q9CZ49 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhl35Q9CZ49 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhl35Q9CZ49 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhl35Q9CZ49 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhl35Q9CZ49 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl35Q9CZ49 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl35Q9CZ49 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klhl35Q9CZ49 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl35Q9CZ49 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Klhl35Q9CZ49 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl35Q9CZ49 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl35Q9CZ49 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl35Q9CZ49 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl35Q9CZ49 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl35Q9CZ49 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl35Q9CZ49 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl35Q9CZ49 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl35Q9CZ49 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl35Q9CZ49 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl35Q9CZ49 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl35Q9CZ49 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl35Q9CZ49 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl35Q9CZ49 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl35Q9CZ49 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl35Q9CZ49 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Klhl35Q9CZ49 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl35Q9CZ49 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl35Q9CZ49 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Klhl35Q9CZ49 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Klhl35Q9CZ49 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Klhl35Q9CZ49 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl35Q9CZ49 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Klhl35Q9CZ49 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Klhl35Q9CZ49 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Klhl35Q9CZ49 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl35Q9CZ49 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Klhl35Q9CZ49 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Klhl35Q9CZ49 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl35Q9CZ49 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl35Q9CZ49 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl35Q9CZ49 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl35Q9CZ49 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl35Q9CZ49 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Klhl35Q9CZ49 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl35Q9CZ49 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl35Q9CZ49 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Klhl35Q9CZ49 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl35Q9CZ49 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Klhl35Q9CZ49 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl35Q9CZ49 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl35Q9CZ49 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl35Q9CZ49 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Klhl35Q9CZ49 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Klhl35Q9CZ49 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Klhl35Q9CZ49 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl35Q9CZ49 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Klhl35Q9CZ49 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl35Q9CZ49 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Klhl35Q9CZ49 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Klhl35Q9CZ49 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129 ms