Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYD3

Crtap, Cartilage-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrtapQ9CYD3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CrtapQ9CYD3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CrtapQ9CYD3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CrtapQ9CYD3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CrtapQ9CYD3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrtapQ9CYD3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CrtapQ9CYD3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrtapQ9CYD3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CrtapQ9CYD3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CrtapQ9CYD3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CrtapQ9CYD3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms