Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Exo5Q9CXP9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Exo5Q9CXP9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Exo5Q9CXP9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exo5Q9CXP9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Exo5Q9CXP9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exo5Q9CXP9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Exo5Q9CXP9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Exo5Q9CXP9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exo5Q9CXP9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Exo5Q9CXP9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Exo5Q9CXP9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Exo5Q9CXP9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Exo5Q9CXP9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Exo5Q9CXP9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Exo5Q9CXP9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exo5Q9CXP9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exo5Q9CXP9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exo5Q9CXP9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exo5Q9CXP9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Exo5Q9CXP9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exo5Q9CXP9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exo5Q9CXP9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exo5Q9CXP9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Exo5Q9CXP9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Exo5Q9CXP9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Exo5Q9CXP9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exo5Q9CXP9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Exo5Q9CXP9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Exo5Q9CXP9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Exo5Q9CXP9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exo5Q9CXP9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exo5Q9CXP9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exo5Q9CXP9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Exo5Q9CXP9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exo5Q9CXP9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exo5Q9CXP9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Exo5Q9CXP9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Exo5Q9CXP9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Exo5Q9CXP9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Exo5Q9CXP9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Exo5Q9CXP9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Exo5Q9CXP9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Exo5Q9CXP9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Exo5Q9CXP9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exo5Q9CXP9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Exo5Q9CXP9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Exo5Q9CXP9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Exo5Q9CXP9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Exo5Q9CXP9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exo5Q9CXP9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exo5Q9CXP9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Exo5Q9CXP9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exo5Q9CXP9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exo5Q9CXP9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Exo5Q9CXP9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exo5Q9CXP9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Exo5Q9CXP9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exo5Q9CXP9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Exo5Q9CXP9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exo5Q9CXP9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Exo5Q9CXP9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Exo5Q9CXP9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Exo5Q9CXP9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Exo5Q9CXP9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Exo5Q9CXP9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Exo5Q9CXP9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Exo5Q9CXP9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Exo5Q9CXP9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Exo5Q9CXP9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Exo5Q9CXP9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Exo5Q9CXP9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Exo5Q9CXP9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms