Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RpainQ9CWY9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RpainQ9CWY9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RpainQ9CWY9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RpainQ9CWY9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RpainQ9CWY9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RpainQ9CWY9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RpainQ9CWY9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RpainQ9CWY9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RpainQ9CWY9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RpainQ9CWY9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RpainQ9CWY9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RpainQ9CWY9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RpainQ9CWY9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RpainQ9CWY9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RpainQ9CWY9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RpainQ9CWY9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RpainQ9CWY9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RpainQ9CWY9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RpainQ9CWY9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RpainQ9CWY9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RpainQ9CWY9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RpainQ9CWY9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RpainQ9CWY9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RpainQ9CWY9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RpainQ9CWY9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RpainQ9CWY9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RpainQ9CWY9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RpainQ9CWY9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RpainQ9CWY9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RpainQ9CWY9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RpainQ9CWY9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RpainQ9CWY9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RpainQ9CWY9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RpainQ9CWY9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RpainQ9CWY9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RpainQ9CWY9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RpainQ9CWY9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RpainQ9CWY9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RpainQ9CWY9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RpainQ9CWY9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RpainQ9CWY9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RpainQ9CWY9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RpainQ9CWY9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RpainQ9CWY9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RpainQ9CWY9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RpainQ9CWY9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RpainQ9CWY9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RpainQ9CWY9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RpainQ9CWY9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RpainQ9CWY9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RpainQ9CWY9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RpainQ9CWY9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RpainQ9CWY9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RpainQ9CWY9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RpainQ9CWY9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RpainQ9CWY9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RpainQ9CWY9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RpainQ9CWY9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RpainQ9CWY9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RpainQ9CWY9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RpainQ9CWY9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RpainQ9CWY9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RpainQ9CWY9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RpainQ9CWY9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RpainQ9CWY9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RpainQ9CWY9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RpainQ9CWY9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RpainQ9CWY9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RpainQ9CWY9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RpainQ9CWY9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RpainQ9CWY9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RpainQ9CWY9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RpainQ9CWY9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RpainQ9CWY9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RpainQ9CWY9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RpainQ9CWY9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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