Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkiras2Q9CR56 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkiras2Q9CR56 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkiras2Q9CR56 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkiras2Q9CR56 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkiras2Q9CR56 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkiras2Q9CR56 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkiras2Q9CR56 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkiras2Q9CR56 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkiras2Q9CR56 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkiras2Q9CR56 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkiras2Q9CR56 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkiras2Q9CR56 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkiras2Q9CR56 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkiras2Q9CR56 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkiras2Q9CR56 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkiras2Q9CR56 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkiras2Q9CR56 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkiras2Q9CR56 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nkiras2Q9CR56 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkiras2Q9CR56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkiras2Q9CR56 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nkiras2Q9CR56 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkiras2Q9CR56 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nkiras2Q9CR56 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nkiras2Q9CR56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkiras2Q9CR56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkiras2Q9CR56 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nkiras2Q9CR56 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nkiras2Q9CR56 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nkiras2Q9CR56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkiras2Q9CR56 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nkiras2Q9CR56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkiras2Q9CR56 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkiras2Q9CR56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkiras2Q9CR56 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkiras2Q9CR56 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkiras2Q9CR56 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkiras2Q9CR56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkiras2Q9CR56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkiras2Q9CR56 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkiras2Q9CR56 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkiras2Q9CR56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkiras2Q9CR56 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkiras2Q9CR56 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkiras2Q9CR56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkiras2Q9CR56 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkiras2Q9CR56 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkiras2Q9CR56 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkiras2Q9CR56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkiras2Q9CR56 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkiras2Q9CR56 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkiras2Q9CR56 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkiras2Q9CR56 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkiras2Q9CR56 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nkiras2Q9CR56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkiras2Q9CR56 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkiras2Q9CR56 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms