Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Psmd9Q9CR00 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmd9Q9CR00 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Psmd9Q9CR00 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Psmd9Q9CR00 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmd9Q9CR00 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmd9Q9CR00 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Psmd9Q9CR00 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Psmd9Q9CR00 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmd9Q9CR00 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Psmd9Q9CR00 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmd9Q9CR00 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Psmd9Q9CR00 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Psmd9Q9CR00 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd9Q9CR00 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Psmd9Q9CR00 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd9Q9CR00 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd9Q9CR00 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Psmd9Q9CR00 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Psmd9Q9CR00 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Psmd9Q9CR00 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Psmd9Q9CR00 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd9Q9CR00 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Psmd9Q9CR00 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Psmd9Q9CR00 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Psmd9Q9CR00 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmd9Q9CR00 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Psmd9Q9CR00 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Psmd9Q9CR00 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Psmd9Q9CR00 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Psmd9Q9CR00 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psmd9Q9CR00 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmd9Q9CR00 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd9Q9CR00 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmd9Q9CR00 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmd9Q9CR00 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd9Q9CR00 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmd9Q9CR00 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmd9Q9CR00 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Psmd9Q9CR00 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd9Q9CR00 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmd9Q9CR00 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd9Q9CR00 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmd9Q9CR00 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmd9Q9CR00 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd9Q9CR00 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmd9Q9CR00 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd9Q9CR00 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd9Q9CR00 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd9Q9CR00 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmd9Q9CR00 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd9Q9CR00 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd9Q9CR00 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd9Q9CR00 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd9Q9CR00 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd9Q9CR00 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd9Q9CR00 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd9Q9CR00 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmd9Q9CR00 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmd9Q9CR00 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Psmd9Q9CR00 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmd9Q9CR00 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd9Q9CR00 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmd9Q9CR00 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Psmd9Q9CR00 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd9Q9CR00 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd9Q9CR00 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psmd9Q9CR00 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd9Q9CR00 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psmd9Q9CR00 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psmd9Q9CR00 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd9Q9CR00 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psmd9Q9CR00 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd9Q9CR00 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Psmd9Q9CR00 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd9Q9CR00 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd9Q9CR00 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psmd9Q9CR00 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psmd9Q9CR00 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms