Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY9

Ndufc1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufc1Q9CQY9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufc1Q9CQY9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufc1Q9CQY9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufc1Q9CQY9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufc1Q9CQY9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufc1Q9CQY9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufc1Q9CQY9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufc1Q9CQY9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufc1Q9CQY9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufc1Q9CQY9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ndufc1Q9CQY9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufc1Q9CQY9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufc1Q9CQY9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ndufc1Q9CQY9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufc1Q9CQY9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufc1Q9CQY9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufc1Q9CQY9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufc1Q9CQY9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ndufc1Q9CQY9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ndufc1Q9CQY9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufc1Q9CQY9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufc1Q9CQY9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufc1Q9CQY9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms