Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PsenenQ9CQR7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PsenenQ9CQR7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PsenenQ9CQR7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PsenenQ9CQR7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PsenenQ9CQR7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PsenenQ9CQR7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PsenenQ9CQR7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PsenenQ9CQR7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PsenenQ9CQR7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PsenenQ9CQR7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PsenenQ9CQR7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PsenenQ9CQR7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PsenenQ9CQR7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PsenenQ9CQR7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PsenenQ9CQR7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PsenenQ9CQR7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PsenenQ9CQR7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PsenenQ9CQR7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PsenenQ9CQR7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PsenenQ9CQR7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PsenenQ9CQR7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PsenenQ9CQR7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PsenenQ9CQR7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PsenenQ9CQR7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PsenenQ9CQR7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PsenenQ9CQR7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PsenenQ9CQR7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PsenenQ9CQR7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PsenenQ9CQR7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PsenenQ9CQR7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PsenenQ9CQR7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PsenenQ9CQR7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PsenenQ9CQR7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PsenenQ9CQR7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PsenenQ9CQR7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PsenenQ9CQR7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PsenenQ9CQR7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PsenenQ9CQR7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PsenenQ9CQR7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PsenenQ9CQR7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PsenenQ9CQR7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PsenenQ9CQR7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PsenenQ9CQR7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PsenenQ9CQR7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PsenenQ9CQR7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PsenenQ9CQR7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PsenenQ9CQR7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PsenenQ9CQR7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PsenenQ9CQR7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PsenenQ9CQR7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PsenenQ9CQR7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PsenenQ9CQR7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PsenenQ9CQR7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PsenenQ9CQR7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PsenenQ9CQR7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PsenenQ9CQR7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PsenenQ9CQR7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PsenenQ9CQR7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PsenenQ9CQR7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PsenenQ9CQR7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PsenenQ9CQR7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms