Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN4

Sostdc1, Sclerostin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sostdc1Q9CQN4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sostdc1Q9CQN4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sostdc1Q9CQN4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sostdc1Q9CQN4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sostdc1Q9CQN4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sostdc1Q9CQN4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sostdc1Q9CQN4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sostdc1Q9CQN4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sostdc1Q9CQN4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sostdc1Q9CQN4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sostdc1Q9CQN4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sostdc1Q9CQN4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sostdc1Q9CQN4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sostdc1Q9CQN4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sostdc1Q9CQN4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sostdc1Q9CQN4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sostdc1Q9CQN4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sostdc1Q9CQN4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sostdc1Q9CQN4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sostdc1Q9CQN4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sostdc1Q9CQN4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sostdc1Q9CQN4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sostdc1Q9CQN4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sostdc1Q9CQN4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sostdc1Q9CQN4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sostdc1Q9CQN4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sostdc1Q9CQN4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sostdc1Q9CQN4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sostdc1Q9CQN4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sostdc1Q9CQN4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sostdc1Q9CQN4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sostdc1Q9CQN4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sostdc1Q9CQN4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sostdc1Q9CQN4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sostdc1Q9CQN4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sostdc1Q9CQN4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sostdc1Q9CQN4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sostdc1Q9CQN4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sostdc1Q9CQN4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sostdc1Q9CQN4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sostdc1Q9CQN4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sostdc1Q9CQN4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sostdc1Q9CQN4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sostdc1Q9CQN4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sostdc1Q9CQN4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sostdc1Q9CQN4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sostdc1Q9CQN4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sostdc1Q9CQN4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms