Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl39lQ9CQD0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl39lQ9CQD0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl39lQ9CQD0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpl39lQ9CQD0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl39lQ9CQD0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl39lQ9CQD0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl39lQ9CQD0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl39lQ9CQD0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rpl39lQ9CQD0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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