Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mrpl49Q9CQ40 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mrpl49Q9CQ40 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Mrpl49Q9CQ40 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mrpl49Q9CQ40 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mrpl49Q9CQ40 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl49Q9CQ40 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl49Q9CQ40 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl49Q9CQ40 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl49Q9CQ40 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrpl49Q9CQ40 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl49Q9CQ40 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mrpl49Q9CQ40 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Mrpl49Q9CQ40 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mrpl49Q9CQ40 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrpl49Q9CQ40 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl49Q9CQ40 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl49Q9CQ40 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl49Q9CQ40 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mrpl49Q9CQ40 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl49Q9CQ40 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mrpl49Q9CQ40 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl49Q9CQ40 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl49Q9CQ40 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl49Q9CQ40 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl49Q9CQ40 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl49Q9CQ40 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl49Q9CQ40 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl49Q9CQ40 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl49Q9CQ40 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl49Q9CQ40 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl49Q9CQ40 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl49Q9CQ40 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl49Q9CQ40 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl49Q9CQ40 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl49Q9CQ40 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl49Q9CQ40 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl49Q9CQ40 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl49Q9CQ40 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl49Q9CQ40 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl49Q9CQ40 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl49Q9CQ40 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl49Q9CQ40 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl49Q9CQ40 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mrpl49Q9CQ40 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl49Q9CQ40 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl49Q9CQ40 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mrpl49Q9CQ40 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mrpl49Q9CQ40 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl49Q9CQ40 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl49Q9CQ40 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl49Q9CQ40 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mrpl49Q9CQ40 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl49Q9CQ40 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrpl49Q9CQ40 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrpl49Q9CQ40 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl49Q9CQ40 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrpl49Q9CQ40 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl49Q9CQ40 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrpl49Q9CQ40 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl49Q9CQ40 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl49Q9CQ40 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl49Q9CQ40 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl49Q9CQ40 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl49Q9CQ40 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl49Q9CQ40 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl49Q9CQ40 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl49Q9CQ40 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl49Q9CQ40 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl49Q9CQ40 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl49Q9CQ40 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl49Q9CQ40 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrpl49Q9CQ40 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mrpl49Q9CQ40 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl49Q9CQ40 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl49Q9CQ40 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrpl49Q9CQ40 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl49Q9CQ40 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl49Q9CQ40 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl49Q9CQ40 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl49Q9CQ40 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl49Q9CQ40 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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