Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnaseh2cQ9CQ18 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnaseh2cQ9CQ18 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnaseh2cQ9CQ18 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnaseh2cQ9CQ18 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnaseh2cQ9CQ18 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnaseh2cQ9CQ18 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnaseh2cQ9CQ18 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnaseh2cQ9CQ18 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnaseh2cQ9CQ18 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnaseh2cQ9CQ18 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnaseh2cQ9CQ18 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnaseh2cQ9CQ18 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnaseh2cQ9CQ18 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnaseh2cQ9CQ18 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnaseh2cQ9CQ18 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnaseh2cQ9CQ18 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnaseh2cQ9CQ18 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
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