Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms