Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox6cQ9CPQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cox6cQ9CPQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cox6cQ9CPQ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cox6cQ9CPQ1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cox6cQ9CPQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cox6cQ9CPQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cox6cQ9CPQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cox6cQ9CPQ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms