Protein–RNA interactions for Protein: Q99P50

Ghsr, Growth hormone secretagogue receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhsrQ99P50 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GhsrQ99P50 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GhsrQ99P50 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GhsrQ99P50 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GhsrQ99P50 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GhsrQ99P50 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GhsrQ99P50 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GhsrQ99P50 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GhsrQ99P50 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GhsrQ99P50 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GhsrQ99P50 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GhsrQ99P50 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GhsrQ99P50 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GhsrQ99P50 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GhsrQ99P50 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GhsrQ99P50 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GhsrQ99P50 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GhsrQ99P50 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GhsrQ99P50 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GhsrQ99P50 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GhsrQ99P50 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GhsrQ99P50 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GhsrQ99P50 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GhsrQ99P50 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GhsrQ99P50 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GhsrQ99P50 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GhsrQ99P50 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GhsrQ99P50 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GhsrQ99P50 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GhsrQ99P50 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GhsrQ99P50 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GhsrQ99P50 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GhsrQ99P50 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GhsrQ99P50 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GhsrQ99P50 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GhsrQ99P50 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GhsrQ99P50 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GhsrQ99P50 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GhsrQ99P50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GhsrQ99P50 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GhsrQ99P50 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GhsrQ99P50 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GhsrQ99P50 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GhsrQ99P50 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
GhsrQ99P50 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GhsrQ99P50 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GhsrQ99P50 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GhsrQ99P50 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GhsrQ99P50 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GhsrQ99P50 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GhsrQ99P50 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GhsrQ99P50 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GhsrQ99P50 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GhsrQ99P50 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GhsrQ99P50 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms