Protein–RNA interactions for Protein: Q99MZ7

Pecr, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PecrQ99MZ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PecrQ99MZ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PecrQ99MZ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PecrQ99MZ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PecrQ99MZ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PecrQ99MZ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PecrQ99MZ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PecrQ99MZ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PecrQ99MZ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PecrQ99MZ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PecrQ99MZ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PecrQ99MZ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PecrQ99MZ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PecrQ99MZ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PecrQ99MZ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PecrQ99MZ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PecrQ99MZ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PecrQ99MZ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PecrQ99MZ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PecrQ99MZ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PecrQ99MZ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PecrQ99MZ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PecrQ99MZ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PecrQ99MZ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PecrQ99MZ7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PecrQ99MZ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PecrQ99MZ7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PecrQ99MZ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PecrQ99MZ7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PecrQ99MZ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PecrQ99MZ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PecrQ99MZ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PecrQ99MZ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PecrQ99MZ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PecrQ99MZ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PecrQ99MZ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PecrQ99MZ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PecrQ99MZ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PecrQ99MZ7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PecrQ99MZ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PecrQ99MZ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PecrQ99MZ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PecrQ99MZ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PecrQ99MZ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PecrQ99MZ7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PecrQ99MZ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PecrQ99MZ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PecrQ99MZ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PecrQ99MZ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PecrQ99MZ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PecrQ99MZ7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PecrQ99MZ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PecrQ99MZ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PecrQ99MZ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PecrQ99MZ7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PecrQ99MZ7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PecrQ99MZ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PecrQ99MZ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PecrQ99MZ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms