Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gps1Q99LD4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gps1Q99LD4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gps1Q99LD4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gps1Q99LD4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gps1Q99LD4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gps1Q99LD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gps1Q99LD4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gps1Q99LD4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gps1Q99LD4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gps1Q99LD4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gps1Q99LD4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gps1Q99LD4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gps1Q99LD4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gps1Q99LD4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gps1Q99LD4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gps1Q99LD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gps1Q99LD4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gps1Q99LD4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gps1Q99LD4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gps1Q99LD4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gps1Q99LD4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gps1Q99LD4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gps1Q99LD4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gps1Q99LD4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gps1Q99LD4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gps1Q99LD4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gps1Q99LD4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gps1Q99LD4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gps1Q99LD4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gps1Q99LD4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gps1Q99LD4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gps1Q99LD4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gps1Q99LD4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gps1Q99LD4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Gps1Q99LD4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gps1Q99LD4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gps1Q99LD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gps1Q99LD4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gps1Q99LD4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gps1Q99LD4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gps1Q99LD4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gps1Q99LD4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gps1Q99LD4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gps1Q99LD4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gps1Q99LD4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gps1Q99LD4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gps1Q99LD4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gps1Q99LD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gps1Q99LD4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gps1Q99LD4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gps1Q99LD4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gps1Q99LD4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gps1Q99LD4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gps1Q99LD4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gps1Q99LD4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gps1Q99LD4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gps1Q99LD4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gps1Q99LD4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gps1Q99LD4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gps1Q99LD4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gps1Q99LD4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gps1Q99LD4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gps1Q99LD4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gps1Q99LD4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gps1Q99LD4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gps1Q99LD4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gps1Q99LD4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gps1Q99LD4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gps1Q99LD4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gps1Q99LD4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gps1Q99LD4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gps1Q99LD4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gps1Q99LD4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gps1Q99LD4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gps1Q99LD4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gps1Q99LD4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gps1Q99LD4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms