Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Psip1Q99JF8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Psip1Q99JF8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Psip1Q99JF8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psip1Q99JF8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psip1Q99JF8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psip1Q99JF8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psip1Q99JF8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psip1Q99JF8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Psip1Q99JF8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psip1Q99JF8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psip1Q99JF8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psip1Q99JF8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psip1Q99JF8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psip1Q99JF8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psip1Q99JF8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psip1Q99JF8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psip1Q99JF8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psip1Q99JF8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psip1Q99JF8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psip1Q99JF8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psip1Q99JF8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psip1Q99JF8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psip1Q99JF8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psip1Q99JF8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psip1Q99JF8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psip1Q99JF8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psip1Q99JF8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Psip1Q99JF8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psip1Q99JF8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Psip1Q99JF8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Psip1Q99JF8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Psip1Q99JF8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psip1Q99JF8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psip1Q99JF8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psip1Q99JF8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Psip1Q99JF8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Psip1Q99JF8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Psip1Q99JF8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psip1Q99JF8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psip1Q99JF8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Psip1Q99JF8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psip1Q99JF8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Psip1Q99JF8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psip1Q99JF8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Psip1Q99JF8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Psip1Q99JF8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Psip1Q99JF8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Psip1Q99JF8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Psip1Q99JF8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psip1Q99JF8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psip1Q99JF8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Psip1Q99JF8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psip1Q99JF8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Psip1Q99JF8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Psip1Q99JF8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Psip1Q99JF8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Psip1Q99JF8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Psip1Q99JF8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psip1Q99JF8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Psip1Q99JF8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Psip1Q99JF8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Psip1Q99JF8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Psip1Q99JF8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Psip1Q99JF8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Psip1Q99JF8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Psip1Q99JF8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Psip1Q99JF8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Psip1Q99JF8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psip1Q99JF8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Psip1Q99JF8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Psip1Q99JF8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Psip1Q99JF8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psip1Q99JF8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Psip1Q99JF8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psip1Q99JF8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Psip1Q99JF8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Psip1Q99JF8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Psip1Q99JF8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms